Dnia 7 marca 2018 roku Naczelny Sąd Administracyjny wydał wyrok (sygn. I FSK 769/16) w sprawie dotyczącej odliczonej podatku naliczonego z faktur wystawionych przez podmiot niezarejestrowany na VAT.
Sprawa dotyczyła firmy, która nabywała usługi informatyczne od podmiotu, który jak się okazało po kilku miesiącach, nie był zarejestrowany w CEIDG ani na potrzeby podatku VAT. Niemniej, same usługi były wykonywane, firma otrzymywała z tego tytułu faktury VAT wystawione przez kontrahenta oraz odliczała z nich podatek naliczony.
Organy podatkowe zakwestionowały prawo do odliczenia podatku naliczonego powołując się na brak zachowania należytej staranności przy wyborze kontrahenta, co doprowadziło do udziału w transakcjach będącymi nadużyciami podatkowymi.
Sprawa ostatecznie trafiła do NSA, który podkreślił, że brak rejestracji sprzedawcy na VAT, jak też niewywiązywanie się przez niego z obowiązku deklarowania i płacenia należnego podatku VAT, nie może automatycznie pozbawiać nabywcy prawa do odliczenia podatku naliczonego w sytuacji, gdy dane usługi zostały faktycznie wykonane a nabywca nie działał świadomie w celu nadużycia prawa.
