W dniu 20 lutego 2018 roku Wojewódzki Sąd Administracyjny w Warszawie wydał wyrok (sygn. III SA/Wa 1896/17) w sprawie, w której organ podatkowy odmówił spółce prawa do zwrotu nadwyżki podatku naliczonego nad należnym pomimo wcześniejszego uzyskania przez nią pozytywnej interpretacji w tym zakresie.
Sprawa dotyczyła spółki, która wystąpiła z wnioskiem o zwrot VAT w związku nabyciem centrum handlowego. Przed dokonaniem transakcji spółka uzyskała interpretację indywidulaną potwierdzającą prawo spółki do odliczenia podatku naliczonego w związku z tą transakcją.
Niemniej, organ podatkowy odmówił spółce prawa do zwrotu podatku VAT. Stwierdził przy tym, iż otrzymana przez spółkę interpretacja chroni ją jedynie przed obowiązkiem zapłaty VAT i ewentualnych odsetek za zwłokę. Nie jest ona natomiast wiążąca dla organu, jeżeli podatnik występuje o zwrotu podatku.
WSA uchylił tę decyzję stwierdzając, że podatnik stosujący się do wydanej dla danego stanu faktycznego interpretacji podatkowej powinien być w tym zakresie chroniony w sposób szeroki, a więc zarówno przed obowiązkiem zapłaty podatku VAT i odsetek, jak również przed odmową zwrotu podatku.
Wyrok jest nieprawomocny.
